Suzume e Sota lasciano il Kyushu e si mettono in viaggio per chiudere le porte ed evitare che il verme provochi altre catastrofi naturali. Daijin, la pietra di volta che ha assunto le sembianze di un gatto, sta vagando per il Giappone, aprendo una porta dietro l’altra. I ragazzi, sulle sue tracce, arrivano fino a Kobe. Nel frattempo, Sota percepisce che qualcosa in lui è cambiato…